vendredi 21 novembre 2014

Je suis vieux : changements dans la perception du risque

[caption id="attachment_2604" align="aligncenter" width="215"]incroyable liste de citations sur le thème "c'était mieux avant" à lire en cliquant incroyable liste de citations sur le thème "c'était mieux avant" à lire en cliquant[/caption]

  • quand j'étais étudiant en licence (bachelor pour les suisses), si on osait suggérer à un collègue de ne pas fumer dans l'amphi pendant la pause entre cours, on se faisait vertement rabrouer.

  • on se serait fait tuer plutôt que de se ridiculiser avec un casque de vélo, surtout pour venir à la fac ; le genre de casque que je porte aujourd'hui et que portent la plupart des étudiants que je vois à vélo.

  • quand j'étais nettement plus jeune, il était très difficile pour un enfant d'obtenir une patisserie sans alcool dans une boulangerie-patisserie (mon expérience se limite au sud de la France) ; "il y en a juste un peu" disaient-il en me donnant des gateaux plein de je-ne-sais quelle liqueur (que je détestais et détectais immédiatement, beurk).

  • j'ai fait de longs voyages en avion avec une moitié de la cabine fumeurs, et un rideau pas vraiment efficace pour empêcher la fumée de traverser vers l'autre moitié.

  • et pendant mon adolescence les gens s'inquiétaient des conséquences dangereuses pour les jeunes des jeux de rôles papier-crayon-dé (pas d'ordinateur)...


Tout ceci pour dire que la perception du risque a bien changé, et souvent en mieux. Et que je suis vieux.

Editions précédentes d'un exercice similaire :

jeudi 20 novembre 2014

La pire note de mes études : 2/20 en physiologie végétale (si si) #myworstgrade

[caption id="attachment_2594" align="aligncenter" width="474"]cliquez sur l'image : pédagogie ! cliquez sur l'image : pédagogie ![/caption]

Y a un hashtage #myworstgrade qui circule sur Twitter, où des personnes ayant réussi en science disent quelle a été leur pire note.

Je dois maintenant l'avouer publiquement : j'ai une très mauvaise mémoire. Et bêtement, j'ai choisi biologie, avec plein de par cœur les premières années. Donc mes plus mauvaises notes étaient largement déconnectées de mon intérêt pour les matières, et largement liées au type d'examen : plus il fallait apprendre par cœur, plus je me plantais.

D'où un 2/20 lamentable en physiologie végétale en 2ème année de biologie, matière où contrairement à ce que le nom implique nous ne faisions qu'apprendre par cœur (ou échouer à apprendre par cœur) des séries de réactions chimiques se produisant dans les plantes.

Je n'en ai pas gardé rancune à la physiologie ni aux plantes, mais je ne pose jamais de questions de par cœur en examen...

Et le point important : j'ai survécu, j'ai continué en biologie, tada me voici. Curieusement les très bonnes notes en informatique et en anglais, qui semblaient anecdotiques quand je les ai eu en 3ème année, sont probablement les compétences m'ayant le plus servi. Comme quoi.

Donc : si avez une mauvaise note, ne vous jetez pas du haut d'un pont. Rappelez-vous, la science c'est cool.

jeudi 13 novembre 2014

Que reproche-t-on à la conseillère scientifique à la commission européenne ?

[caption id="attachment_2581" align="aligncenter" width="150"]cliquez sur l'image cliquez sur l'image[/caption]

Alors, ça y est, le poste de conseiller scientifique à la commission européenne a été supprimé. A l'heure où j'écris, heureusement qu'il y a les les québecois de La Presse pour en parler en francophonie, parce que Pierre Barthélémy et Sylvestre Huet n'ont même pas jugé bon de retweeter une lien vers une info (l'article de Jean-François Cliche à La Presse montre aussi comment on peut intégrer Twitter et les blogs au journalisme scientifique, hum hum) [mises à jour : échange avec Pierre Barthélémy dans les commentaires de son blog ; échange Twitter s'en étant suivi ; Sylvestre Huet a retweeté et engagé le représentant de Libération à Brusselles, qui a dit qu'il suivait ; ça bouge]. Faut dire que la commission a joué fin en faisant ça au moment où tout le monde regardait l'arrivée de Philae sur la comète. Ce qui en soi tend à indiquer qu'ils ne sont pas particulièrement fiers de leur action.

J'ai déjà pas mal parlé de la campagne de différents groupes anti-OGM pour demander que ce poste soit supprimé (billet 1, billet 2). Demandons-nous ce que l'on reproche à Anne Glover (la conseillère sortante) ?

Officiellement, rien, on a supprimé le poste. Si vraiment on reprochait quelque chose à Anne Glover, on la remplacerait. Faut être clair, on supprime le poste de conseiller scientifique parce qu'on ne veut pas de conseil scientifique.

Dans la lettre d'août des organisations anti-OGM, sa prise de position sur les OGM était explicitement visée. En août, tout ce que j'avais trouvé de cité par ces mêmes organisations était qu'en septembre 2013 Anne Glover a cité avec approbation les conclusions d'un rapport établi par l'association regroupant toutes les académies des sciences européennes, lesquelles conclusions étaient que toute la litérature scientifique montre que les OGM ne sont pas particuliérement dangereux. J'ai mis du gras, parce qu'on trouve répété à l'envi l'affirmation selon laquelle le problème serait qu'Anne Glover aurait décidé toute seule que les OGM c'est cool. Non, cette affirmation est fausse.

Pour des avis divers sur les OGM, voir les dialogues que j'ai eu avec des collègues biologistes d'horizons divers, et les commentaires qu'ils ont généré (commencer ici et suivre les liens) ; aucun collègue n'affirme de risque particulier aux OGM, y compris ceux qui ne sont pas à l'aise avec la biotechnologie.

En lisant un article de la BBC sur la suppression du poste, je trouve qu'un an mois après ce rapport à-peu-près, Anne Glover a déclaré que s'opposer aux OGM en raison de risques supposés était "une forme de folie". Ah c'est clair que ce n'était pas très politique comme déclaration, et elle se serait fait remonter les bretelles je n'aurais pas été surpris. On aurait même clarifié les règles de prise de parole de la conseillère, voire changé de conseillère, ça se serait compris. Mais cette prise de parole intempestive, ce qu'elle montre c'est que comme pas mal de scientifiques (mea culpa) elle trouve normal de dire les choses très franchement, ce que ne ferait pas un politicien. Elle ne montre pas qu'elle ait pris une décision pro-OGM toute seule, puisqu'on rappelle qu'il y a eu ce rapport des académies auparavant.

L'autre chose qu'on va beaucoup lui reprocher, notamment dans les colonnes du Monde grâce à Stéphane Foucart, c'est d'avoir retardé la prise de décision concernant les perturbateurs endocriniens. Alors d'abord il faut être clair : les perturbateurs endocriniens existent, ils sont graves, et je suis bien d'accord qu'il faut agir. Ensuite, d'après ce que je comprends, ce qu'Anne Glover a fait a été de prendre en compte plus qu'elle ne l'aurait mérité une lettre de spécialistes d'endocrinologie qui se sont révélés être en conflit d'intérêts. Stratégie typique de semer le doute, faire croire qu'il y a débat où il n'y en a pas, comme sur le climat, le tabac, l'aminate ou les OGM (sur les OGM, les semeurs de doute sont les anti, pour être clair - bien que Stéphane Foucart ait l'air de dire le contraire dans son livre que je n'ai pas lu [mise à jour : Stéphane Foucart m'a contacté, et m'a donné un extrait de son livre qui indique qu'il est d'accord que l'étude de Séralini et al est "semeuse de doute"]). Elle a probablement eu tort de prendre cette lettre aussi au sérieux, même si une conseillère scientifique reste dans son rôle en attirant l'attention sur un débat scientifique, même s'il n'est qu'apparent. Après tout, ce qui caractérise vraiment les pseudo-sciences du doute c'est de se répéter longtemps après qu'on ait montré qu'ils avaient tort. Mais certains cas de doute sont légitimes, et ils sont plus difficiles à distinguer les uns des autres quand ils sont neufs. D'après je comprends, il y a eu un débat organisé par Glover sur les perturbateurs endocriniens, dont les semeurs de doute sont sortis perdants. Si ensuite la commission européenne n'a rien fait, permettez moi de douter que ce soit grâce au pouvoir énorme du conseiller scientifique. Mais à nouveau, si c'est le problème, d'une part pourquoi ne pas changer de conseiller, et d'autre part pourquoi ceci n'est-il jamais mentionné dans la demande de suppression du poste qui a été faite en août (comme remarqué dans les commentaires de l'article de Foucart en septembre d'ailleurs).

Parenthèse : je suis choqué par les gens qui prétendent avoir débusqué un risque majeur pour la santé humaine, et quand on leur demande des détails, il faut regarder un documentaire "excellent" (aucun documentaire télévisé ne vaut un document écrit en ce qui me concerne ; où sont les références, les notes, les nuances ?) qui n'est pas visible hors de France, ou il faut lire des articles réservés abonnés. Visiblement, la santé humaine doit passer avant l'argent des industries mais passe après l'argent des journalistes. (Voir discussions sur la publication ouverte.) Tout ça pour dire que j'ai pas vu ce documentaire, pas lu cet article, et si vous avez des liens sérieux sur le rôle abominable d'Anne Glover, je suis preneur dans les commentaires.

En conclusion, je ne vois rien qui justifie de supprimer le poste de conseiller scientifique, sauf que certains veulent faire du lobbying sans interférence compétente, sans quelqu'un qui respecte les académies des sciences et la litérature scientifique davantage que les sondages. Si les problèmes dont on nous parle étaient la vraie cause, on aurait juste changé de personne et éclairci quelques règles.

Je maintiens ce que j'ai écrit en août : bas les masques, ceux qui ont réclamé ceci et ceux qui l'applaudissent sont anti-science.

mardi 11 novembre 2014

Le scandale des abonnements de revues scientifiques éclate au grand jour

[caption id="attachment_2566" align="aligncenter" width="150"]cliquez pour une explication video en anglais de l'open access cliquez pour une explication video en anglais de l'open access[/caption]

Comme disent les anglophones, the shit hit the fan : Rue89 révèle le montant exhorbitant et les conditions incroyables qu'Elsevier extorque au gouvernement français pour les abonnements.

Alors on rappelle que la publication libre accès (open access) existe depuis des années, marche, est socialement juste, et économiquement efficace. Et on rappelle, comme expliqué dans Rue89, que le système actuel est tout le contraire : un monopole, un marché opaque, la connaissance interdite à pratiquement tous ceux qui en ont besoin, les résultats de la recherche sous-utilisés parce que non utilisables.

Je n'ai pas le temps d'écrire un billet long maintenant, mais d'une part j'ai déjà écrit plusieurs billets sur le sujet :

Et d'autre part, ceci tombe justement après que j'ai lu une super interview de Anurag Acharya, co-créateur du super moteur de recherches Google Scholar (exemples d'utilisation pour la science citoyenne dans ce billet et celui-ci). Un point m'a frappé dans cette interview. Un reproche fréquemment fait à Google Scholar est l'absence d'accès programmatique (API), qui permettrait à des personnes hors Google d'utiliser les informations de manière systématique. Or ce que dit Acharya c'est que cette limitation est due aux contrats que Google a du signer avec les éditeurs scientifiques, comprendre Elsevier et compères : pour pouvoir lire les articles d'accès fermé automatiquement, Google a du s'engager à ne pas permettre à d'autres l'accès à cette information. Et voilà ! Le travail de centaines de milliers de chercheurs payés par les contribuables de tous les pays n'est pas étudiable parce qu'on a donné les clés à Elsevier etc. Si c'était tout publié open access, il n'y aurait aucun problème (j'ai d'ailleurs une collaboration où on fait exactement cela, voir ScienceWise).

J'ai tweetté cela, et même si ce n'est pas les dernières nouvelles de Justin Bieber, ça a été suffisamment retweeté pour montrer que j'avais touché une corde sensible :

La question est évidemment de savoir quelle sera la prochaine étape. Il faut aller vers une obligation de publier en open access, comme l'impose déjà le Welcome Trust, et à mon avis pour cela prendre sur les budgets des bibliothèques, en coupant des abonnements. Je suis un gentil garçon, mais parfois il me prends des envies de révolution...